時ははるか未来。

NEUE（ノイエ）と呼ばれる銀河に存在する惑星セルダール。

セルダール星には別の銀河EDEN（エデン）にあるトランスバール星との友好関係の元に作られた、トランスバール市が存在する。

そこにトランスバール軍によって設立された５人の女の子による特殊部隊、それがルーンエンジェル隊である。

精鋭であるルーンエンジェル隊は紋章機と呼ばれる戦闘機を駆り、広大な宇宙を舞台に大活躍！
……のはずだったのだが……彼女たちは一筋縄ではいかない隊員だらけだったのだ！

マイペースな５人が、気の向くままに何もなくても縦横無尽のドタバタ騒ぎを大展開！
果たして一体どんな愉快な事件がおきるのか!?

ハイテンションSFアクションコメディの決定版！