2013年に発売された PS3/Xbox360『マブラヴ オルタネイティヴ トータル・イクリプス』の内容をさらに洗練。
小説 「帝都燃ゆ」 をベースに、メインヒロインの一人・篁唯依の過去を描いた新規シナリオも追加！

ストーリー
西暦2001年、日本帝国では次期主力戦術機の開発が行き詰まりを見せていた。
そこで、第3世代戦術機・不知火を、米国との協力体制下で改修する 『XFJ計画』 が提案され、帝国斯衛軍・篁唯依中尉が責任者に任命された。

純国産での開発にこそ価値を見いだしていた唯依は、不安と不満を抱えながら、開発が行なわれるアメリカ合衆国・アラスカ州 ユーコン基地に赴くのだった。

同じ頃、米国軍のユウヤ・ブリッジス少尉もまた、ユーコン基地に向かっていた。
彼は 『XFJ計画』 のメイン・テストパイロットに抜擢されたが、不幸な出生ゆえに日本を憎んでおり、大きな不満を抱いて計画に参加する。

当然のごとく、ふたりの間には激しい確執が生まれ、計画の遂行に暗雲が立ちこめた。
これを乗り越えなければ、日本に未来はないのだが――

滅亡の危機に瀕した地球を舞台に、新型戦術機の開発を巡る、熱き人間たちのドラマが今始まる！