2002年から放映された美少女SFアニメの人気テレビシリーズ全24話をもとに、新作作画や物語の組み換えを交えながら三部作に構成した劇場版の第1部。テレビ版も担当し、原作者の一人でもある後藤圭二監督によるディレクターズ・カット版となっている。地球人が外宇宙にその文明を広げた遠い未来。人類は宇宙惑星連合を成立させていた。だが惑星国家間の経済紛争は絶えず、その衝突は時に有事にも発展する。そんな問題を実力で解決するのは、銀河通商関税機構“GOTT”に所属する“ES”メンバーと呼ばれる超能力エージェントたちだった。その中の二人、普段は同機関の受付嬢を装うエクレールとリュミエールの美少女コンビは、本来のESメンバーとして、今度の任務に赴くが……。テレビシリーズの第1～11話あたりをベースに再構成。二人の主人公ヒロインのうち、特にエクレールのスーパーレディぶりを強く打ち出す仕上げになっている。中盤には、インターミッション的な仕様で、映画のメインストーリーから外れたテレビ版の名場面集なども紹介し、ファンサービスにつとめている。