レース中の事故から奇跡の生還を果たした島村ジョーは、不死身の身体と加速装置を持つサイボーグ009であった。彼には、同じく悪の組織ブラックゴーストの改造手術によってサイボーグにされてしまった仲間たちがいた。彼らは人間兵器=サイボーグとしての苦しみや悲しみと葛藤しつつも、世界の平和のため、特殊能力を発揮し、戦い続けるのだ!!
