これまでの“キングダムハーツ“をめぐる戦いが、 キーブレード戦争を引き起こそうと目論むマスター・ゼアノートの 意のままに進んでいたことを知ったソラ達は、 闇に対抗する、７人の光の守護者を揃えようとしていた。 王様とリクは歴戦のキーブレード使いの居場所を探し始め、 ソラ、ドナルド、グーフィーの３人は「心を戻す鍵」を探すために、 再び様々なディズニーのワールドを駆け巡って行くのだった。
