深い森に埋もれたある神殿にたどり着いたリンクは、神殿内のトライフォースから試練を受ける事になり、リンクは気がつくと、ラブレンヌという地方の森の中にいた。 そこでリンクは途中で出会ったインパと共にネールという女性に出会う。しかし、その途端にインパに取り憑いていた闇の司祭ベランが姿を現してネールの体に乗り移り、彼女の力を使って時空を乱し始めてしまう。リンクは正気を取り戻したインパから頼まれ、過去へ連れ去られたネールを取り戻し、乱れた時空を元通りにする為に旅立つ。
